En l’àrea de microbiologia de Proaigües es duen a terme assajos de mostres d’aigües per mitjà de tècniques normalitzades.

L’equipament que disposa esta àrea inclou:

• Incubadors bacteriològics.
• Autoclaus.
• Cabina de flux laminar.
• Microscopi òptic, equipat amb fluorescència.
• Sistemes d’identificació de microorganismes (proves bioquímiques, antigen-anticòs, etc.)